Το Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων ιδρύθηκε το 1964. Έως το 1973 λειτούργησε ως παράρτημα του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης (Α.Π.Θ.). Η ίδρυση της Βιβλιοθήκης του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων έγινε ταυτόχρονα με την ίδρυση του Πανεπιστημίου το 1964 και άρχισε να λειτουργεί το 1965. Οι περιορισμοί που έθεταν οι κτηριακές εγκαταστάσεις του νέου Πανεπιστημίου και, κυρίως, η μεταφορά των μοντέλων που εφάρμοζε το Α.Π.Θ. στην οργάνωση των Βιβλιοθηκών του, είχαν ως αποτέλεσμα την εφαρμογή ενός κατανεμημένου συστήματος Βιβλιοθήκης με τη λειτουργία Σπουδαστηρίων και μιας συντονιστικής υπηρεσίας, της «Κεντρικής Βιβλιοθήκης». Το πρότυπο οργάνωσης με τη λειτουργία Σπουδαστηρίων και συλλογών στις τότε Έδρες εγκαταλείφθηκε σταδιακά με την ίδρυση νέων Τμημάτων, τα οποία οργάνωσαν Βιβλιοθήκες σε επίπεδο Τμήματος. Έτσι, την ίδρυση του κάθε νέου Τμήματος ακολουθούσε η δημιουργία της αντίστοιχης Βιβλιοθήκης.
Με χρονολογική σειρά, αναφέρουμε το έτος δημιουργίας των Σπουδαστηρίων και των Βιβλιοθηκών σε επίπεδο Τμήματος:
Το 1965 σταδιακά δημιουργήθηκαν τα επτά Σπουδαστήρια των σημερινών Τμημάτων Ιστορίας - Αρχαιολογίας και Φιλολογίας της Φιλοσοφικής Σχολής,
Το 1966 δημιουργήθηκε η Βιβλιοθήκη του Τμήματος Μαθηματικών
Το 1970 δημιουργήθηκε Βιβλιοθήκη του Τμήματος Μαθηματικών
Το 1977 δημιουργήθηκε η Βιβλιοθήκη του Τμήματος Χημείας
Το 1977 της Ιατρικής Σχολής (διάσπαρτη στις πρώην Έδρες και στις Κλινικές). Η ανέγερση των νέων κτηρίων της Ιατρικής Σχολής στην Πανεπιστημιούπολη, έδωσε τη δυνατότητα για την ενοποίηση των μικρών συλλογών που διατηρούσαν οι πρώην Έδρες και Κλινικές της Ιατρικής Σχολής και τη λειτουργία από το 1998 της Ενιαίας Βιβλιοθήκης της Ιατρικής Σχολής.
Το 1984 δημιουργήθηκε η Βιβλιοθήκη του Παιδαγωγικού Τμήματος Δημοτικής Εκπαίδευσης
Το 1987 του Παιδαγωγικού Τμήματος Νηπιαγωγών
Το 1993 του Τμήματος Πληροφορικής το οποίο το 2013 μετονομάστηκε σε Τμήμα Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορικής
Το 1996 ολοκληρώθηκε η ενοποίηση των Βιβλιοθηκών των Τμημάτων Φιλοσοφίας, Παιδαγωγικής και Ψυχολογίας (Φ.Π.Ψ.), Παιδαγωγικού Τμήματος Δημοτικής Εκπαίδευσης και Παιδαγωγικού Τμήματος Νηπιαγωγών με την ίδρυση της Διατμηματικής Βιβλιοθήκης της Σχολής Επιστημών Αγωγής και του Τμήματος Φ.Π.Ψ.
Το 1998 δημιουργήθηκε η Βιβλιοθήκη του Τμήματος Οικονομικών Επιστημών
Το 2000 του Τμήματος Επιστήμης και Τεχνολογίας Υλικών
Το 2000 του Τμήματος Πλαστικών Τεχνών και Επιστημών της Τέχνης το οποίο το 2016 μετονομάστηκε σε Τμήμα Εικαστικών Τεχνών & Επιστημών της Τέχνης της Σχολής Καλών Τεχνών
Το 2001 η Βιβλιοθήκη του Τμήματος Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών
